{"id":582,"date":"2025-10-27T15:35:10","date_gmt":"2025-10-27T18:35:10","guid":{"rendered":"https:\/\/ingenieria.uner.edu.ar\/nucleos\/informatica_aplicada\/?p=582"},"modified":"2025-10-27T15:36:01","modified_gmt":"2025-10-27T18:36:01","slug":"modelado-y-simulacion-in-silico-del-ciclo-de-la-metionina-una-aproximacion-mediante-redes-de-petri","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/ingenieria.uner.edu.ar\/nucleos\/informatica_aplicada\/index.php\/2025\/10\/27\/modelado-y-simulacion-in-silico-del-ciclo-de-la-metionina-una-aproximacion-mediante-redes-de-petri\/","title":{"rendered":"Modelado y simulaci\u00f3n in silico del ciclo de la metionina: una aproximaci\u00f3n mediante Redes de Petri"},"content":{"rendered":"\t\t<div data-elementor-type=\"wp-post\" data-elementor-id=\"582\" class=\"elementor elementor-582\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-744d1ad1 e-flex e-con-boxed e-con e-parent\" data-id=\"744d1ad1\" data-element_type=\"container\">\n\t\t\t\t\t<div class=\"e-con-inner\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-element elementor-element-68070e77 elementor-widget elementor-widget-text-editor\" data-id=\"68070e77\" data-element_type=\"widget\" data-widget_type=\"text-editor.default\">\n\t\t\t\t<div class=\"elementor-widget-container\">\n\t\t\t<style>\/*! elementor - v3.23.0 - 05-08-2024 *\/\n.elementor-widget-text-editor.elementor-drop-cap-view-stacked .elementor-drop-cap{background-color:#69727d;color:#fff}.elementor-widget-text-editor.elementor-drop-cap-view-framed .elementor-drop-cap{color:#69727d;border:3px solid;background-color:transparent}.elementor-widget-text-editor:not(.elementor-drop-cap-view-default) .elementor-drop-cap{margin-top:8px}.elementor-widget-text-editor:not(.elementor-drop-cap-view-default) .elementor-drop-cap-letter{width:1em;height:1em}.elementor-widget-text-editor .elementor-drop-cap{float:left;text-align:center;line-height:1;font-size:50px}.elementor-widget-text-editor .elementor-drop-cap-letter{display:inline-block}<\/style>\t\t\t\t<!-- wp:heading {\"level\":4} -->\n<h4 class=\"wp-block-heading\">Resumen<\/h4>\n<!-- \/wp:heading --><!-- wp:paragraph -->\n<p>La metionina es un amino\u00e1cido esencial y su metabolismo es importante en procesos clave como la s\u00edntesis de prote\u00ednas y la metilaci\u00f3n del ADN. Alteraciones en este ciclo est\u00e1n asociadas a patolog\u00edas cardiovasculares, trastornos neurodegenerativos y defectos en el desarrollo embrionario. Debido a su complejidad y relevancia biol\u00f3gica, modelar su din\u00e1mica es crucial para comprender mejor c\u00f3mo las alteraciones en el ciclo pueden afectar el equilibrio metab\u00f3lico. En este trabajo se utiliza una red de Petri continua para representar dicho ciclo. Esta es una herramienta matem\u00e1tica muy \u00fatil para representar sistemas concurrentes, y se considera una herramienta eficaz para el modelado y simulaci\u00f3n de sistemas biol\u00f3gicos. Los objetivos de este trabajo fueron modelar el ciclo de metionina y simular la din\u00e1mica de los metabolitos del ciclo ante variaciones en las tasas de entrada de metionina y folato, representando diferentes condiciones fisiol\u00f3gicas. Analizar el impacto de alteraciones enzim\u00e1ticas, como las asociadas a mutaciones. Finalmente, evaluar la utilidad de las redes de Petri en sistemas biol\u00f3gicos frente a otras alternativas. Cada reacci\u00f3n enzim\u00e1tica fue representada utilizando ecuaciones de Michaelis-Menten, incorporando factores de inhibici\u00f3n. Para los par\u00e1metros cin\u00e9ticos se tomaron valores de referencia de modelos previos basados en ecuaciones diferenciales. Para la construcci\u00f3n de la red, cada enzima y metabolito involucrado se represent\u00f3 con lugares. Para cada una de las reacciones, el ingreso y salida de metabolitos se usaron transiciones. Los tokens representaron la concentraci\u00f3n de cada uno de los lugares del sistema. Se usaron diferentes arcos para representar correctamente las relaciones de activaci\u00f3n o inhibici\u00f3n entre los metabolitos y las reacciones, como los arcos normales y los de prueba. El modelo y las simulaciones se realizaron con Snoopy. Obtenidos los resultados, se generaron gr\u00e1ficas con Python y Matplotlib para su correspondiente an\u00e1lisis. Los resultados fueron los siguientes: Se observ\u00f3 una relaci\u00f3n proporcional entre el ingreso de metionina y las concentraciones de HCYS y SAH, mientras que la relaci\u00f3n entre metionina y SAM mostraron un comportamiento logar\u00edtmico, que coincide con el observado en otros modelos. Se observ\u00f3 una relaci\u00f3n lineal negativa entre el ingreso de folato y los niveles de HYCS. Sin embargo, el cambio se da en una escala menor a la esperada. La mutaci\u00f3n del gen MAT1A, que codifica la enzima MAT, puede representarse con una disminuci\u00f3n de la actividad enzim\u00e1tica, por lo que se opt\u00f3 por reducir el valor de Vmax un 25%. Se observ\u00f3 una disminuci\u00f3n en la producci\u00f3n de SAM y acumulaci\u00f3n de metionina libre. La red de Petri continua represent\u00f3 adecuadamente el ciclo de la metionina y permiti\u00f3 simular la din\u00e1mica de sus metabolitos frente a distintas condiciones fisiol\u00f3gicas. Esta herramienta mostr\u00f3 una ventaja comparada a otras alternativas con respecto a su clara representaci\u00f3n gr\u00e1fica, permitiendo seguir el flujo del sistema bajo diferentes estados iniciales y hacer que su manipulaci\u00f3n sea m\u00e1s sencilla e intuitiva. Futuras mejoras incluir\u00e1n la incorporaci\u00f3n de rutas metab\u00f3licas relacionadas, una mayor precisi\u00f3n en los par\u00e1metros cin\u00e9ticos e implementaci\u00f3n de otras extensiones de Redes de Petri.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/www.researchgate.net\/publication\/396426418_Modelado_y_simulacion_in_silico_del_ciclo_de_la_metionina_una_aproximacion_mediante_Redes_de_Petri\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">Ver publicaci\u00f3n<\/a><\/p>\n<!-- \/wp:paragraph -->\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Resumen La metionina es un amino\u00e1cido esencial y su metabolismo es importante en procesos clave como la s\u00edntesis de prote\u00ednas y la metilaci\u00f3n del ADN. Alteraciones en este ciclo est\u00e1n asociadas a patolog\u00edas cardiovasculares, trastornos neurodegenerativos y defectos en el desarrollo embrionario. 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