Reorientación de las prácticas de laboratorio de la asignatura Estructuras Biomoleculares hacia el aprendizaje basado en problemas (ABP) y la integralidad Enseñanza I+D. Experiencia 2022-2023: Pigmentos luminiscentes del exoesqueleto de Tityus trivirtatus. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Schierloh, Pablo
Descripción
Este proyecto de Investigación e Innovación en la práctica docente (PIID) financiado por UNER en 2022, aportó al fortalecimiento de diversos aspectos establecidos en el Perfil Pedagógico Docente (Res. C.D. Nº 353/19), como lo es la integralidad las distintas funciones de la Universidad (enseñanza, investigación y extensión); inclusión en las clases de problemáticas reales de nuestra región y organización de la enseñanza fortaleciendo la articulación entre teoría y práctica, a través de la incorporación la metodología de Aprendizaje Basado en Problemas (ABP); reconocimiento de que la labor docente implica, por un lado, posicionamientos éticos y políticos, que a veces están implícitos pero, aun así, siempre están presentes en las prácticas docentes respecto a los fines de la enseñanza y, por el otro, un trabajo articulado con nuestros pares docentes, el diálogo con ellos, la articulación de actividades. Este último aspecto nos resulta interesante en el proyecto, dado que tanto en la planificación como así también en la etapa de implementación y evaluación, se articularon con quienes conforman el Departamento de Biología de la FIUNER y otros docentes. Consideramos que esto aportará a superar la atomización de las cátedras y la naturalización de las prácticas de enseñanza.

Estrategias innovadoras de reposicionamiento de fármacos en virosis emergentes causantes de síndrome de distress respiratorio agudo. Proyecto de investigación plurianual (PIP-CONICET)

Dir.: Dr. Schierloh, Pablo
Descripción
Este Proyecto de Investigación Plurianual (PIP) financiado por CONICET desde finales 2021, continua un trabajo iniciado en 2020 donde, mediante estrategias de screening virtual y simulaciones de Dinámica Molecular logramos identificar drogas de reposicionamiento con alta afinidad teórica (menos de -11 Kcal/mol) contra una serie de blancos moleculares alternativos a los antivirales utilizados al presente para combatir SARS-CoV1, SARS-CoV2 y Orthohantavirus del nuevo mundo. El objetivo de este proyecto es desarrollar métodos in vitro basados en microscopía óptica multimodal que permitan apoyar o descartar in vitro las hipótesis de re-perfilamiento farmacológico surgidas in sillico.

Monitoreo microbiológico ambiental en 2 instituciones de la Ciudad de Paraná, sometidas a alto riesgo de transmisión de microorganismos aerozolizados. Proyecto de extensión territorial (EAT-UNER)

Dir.: Dr. Schierloh, Pablo
Descripción
Este proyecto de acciones de extensión en territorio (EAT) financiado por UNER en 2021, se desarrolló en el marco de la DISPO impuesta como medida de mitigación de la pandemia COVID-19. La propuesta consistió en evaluar empíricamente en instituciones públicas de la ciudad de Paraná vinculadas a alto riesgo epidemiológico, el efecto medidas de sanitización aeroambiental basadas en radiación UVC. El resultado de este trabajo permitió a los adoptantes (Hospital Militar y Centro de Jubilados y Pensionados provinciales) tomar decisiones de gestión institucional en base a evidencia científica.

Microbiomas: implementación de una serie concatenada de trabajos prácticos y seminarios transversales a las asignaturas Estructuras Biomoleculares y Genética de la licenciatura en Bioinformática-UNER. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Schierloh, Pablo
Descripción
Este proyecto de Investigación e Innovación en la práctica docente (PIID) financiado por UNER en 2021, aportó al fortalecimiento de diversos aspectos establecidos en el Perfil Pedagógico Docente (Res. C.D. Nº 353/19), como lo es la integralidad las distintas funciones de la Universidad (enseñanza, investigación y extensión) y organización de la enseñanza fortaleciendo la articulación entre teoría y práctica.

Dispositivo para el estudio de adhesión bacteriana en prótesis metálicas: formación de biopelículas en contacto con superficies metálicas. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Miño, Gastón
Descripción
La adhesión bacteriana es el primer y más importante paso en la infección de implantes metálicos. Este proceso es complicado y está influenciado por múltiples variables tales como factores ambientales, propiedades concernientes a los microorganismos, propiedades de la superficie del material utilizado, la presencia de proteínas tisulares, etc. Dentro de las propiedades del substrato, encontramos: la composición química del material, la carga eléctrica de la superficie, la hidrofobicidad, la rugosidad de las superficies y la presencia de proteínas específicas de superficie. Una vez producida la adhesión, las bacterias tienen la capacidad de formar estructuras más complejas cuando sensan la presencia de otras bacterias. Esta etapa representa el estadío inicial en la formación de biopelículas. El advenimiento de nuevas técnicas microscópicas junto con el desarrollo de herramientas microfluídicas permitirá encontrar nuevas estrategias para prevenir el efecto infeccioso en prótesis, mediante el estudio y entendimiento de la dinámica de interacción entre la situación microbiana y su respuesta con superficies metálicas. Este proyecto pretende diseñar e implementar dispositivos microfluídicos que permitan la variación de las propiedades de superficie y desarrollar metodologías y técnicas de visualización adecuadas mediante el uso de microscopia y procesarmiento de bioimágenes.

Vigilancia tecnológica y vincularción para el desarrollo de estudios clínicos sobre diagnóstico y tratamiento de COVID-19 en Hospitales de la provincia de Entre Ríos. Acciones de extensión en emergencia (AEE-UNER)

Dir.: Dr. Schierloh, Pablo
Descripción
Este proyecto de acciones de extensión en la Emergencia, financiado por UNER en 2020, se desarrolló en el marco de la ASPO impuesta como medida de mitigación de la pandemia COVID-19. La propuesta consistió en vincular centros de salud de la provincia de Entre Ríos con grupos de investigación interesados en desarrollar estudios clínicos multicéntricos en temáticas vinculadas a la atención y diagnóstico POC ("point-of-care") de pacientes COVID-19.

Diagnóstico por imágenes a micro-escala para la caracterización de la movilidad celular y bacteriana utilizando herramientas microfluídicas. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Miño, Gastón
Descripción
Este proyecto propone generar tecnologías teórica-experimentales aplicadas con base en la informática de bioimágenes y la visión artificial, que permitan estudiar el seguimiento de células o bacterias móviles utilizando herramientas microfluídicas adecuadas junto con diferentes técnicas microscópicas de visualización. El proyecto propuesto se encuadra en el campo de la Bioinformática aplicada al agro y la salud y busca generar herramientas que permitan diagnosticar y clasificar anomalías celulares morfológicas que se vean flejadas en la movilidad. Estas herramientas podrán ofrecer una solución automática al análisis del movimiento celular y proporcionar información estadística de una población celular específica. La transferencia de las mismas al ámbito del agro y la salud producirán un fuerte impacto cuando estas herramientas sean aplicadas a la evaluación de la motilidad espermática.

Diseño y desarrollo de un sistema de microscopia de Iluminación Selectiva de Planos. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Casco, Víctor Hugo
Descripción
En las ciencias biológicas pocos resultados son tan contundentes como los que pueden demostrarse mediante las imágenes de microscopia. Bajo esta premisa, el Laboratorio de Microscopia Aplicada a Estudios Moleculares y Celulares (LAMAE) de la FIUNER se ha caracterizado por desarrollar e implementar técnicas de microscopia óptica. Sin embargo, dichos esfuerzos han estado enfocados en los estudios de especímenes fijados por lo que el presente proyecto constituiría un desafío para la realización de estudios de especímenes biológicos vivos de relativamente gran tamaño que se sumarían a las técnicas de microscopia óptica disponibles. Mediante la presente propuesta se pretende implementar la tecnología de microscopia de iluminación selectiva de planos (SPIM, del inglés: selective plane ilumination microscopy) sobre un sistema invertido del laboratorio. La SPIM se utiliza para generar imágenes multidimensionales de alta resolución de muestras de 100um hasta 5 mm. En el proyecto se propone el diseño y desarrollo de los sistemas de iluminación, de montaje y posicionamiento del porta espécimen. Se empleará el proceso de impresión 3D y en base a motores paso a paso, se construirá el sistema de montaje y posicionamiento del porta espécimen para estudios in vivo.

El rol de las hormonas tiroideas sobre la expresión de cadherinas-cateninas en el cáncer de colon: Alternativas Terapéuticas. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dra. Izaguirre, María Fernanda
Descripción
El cáncer colorrectal (CCR) es la cuarta y tercera causa de muerte en el mundo y en Argentina, respectivamente. Por ello, el diagnóstico temprano y nuevas formas de tratamiento resultan esenciales para controlar la morbi-mortalidad de la enfermedad. La molécula de adhesión intercelular cadherina E y su molécula conectora al citoesqueleto de actina, beta-catenina, son críticas en las transformaciones epitelio-mesénquima, en desarrollo de adenomas y adenocarcinomas de colon-recto. Por estas razones, el control de expresión y funcionalidad, permite regular la movilidad y agresividad de las células tumorales. Empleando modelos de anuros en desarrollo, nuestras investigaciones demostraron que los genes de cadherina E y beta-catenina se encuentran bajo control de la hormona triodotironina (T3). Otros autores, trabajando con modelos murinos, han arribado a conclusiones similares, proponiendo importantes roles en diferenciación versus proliferación celular y metástasis para estas moléculas. Con este proyecto se propone trabajar en modelos murinos de inducción del CCR y profundizar el conocimiento del rol que ejercen las hormonas tiroideas sobre el sistema cadherinas-cateninas en el desarrollo y progresión tumoral. Adicionalmente, se analizarán alternativas terapéuticas del CCR, enfocadas en controlar el nivel de hormonas tiroideas extra e intracelulares.

Análisis, procesamiento y modelado de la criptogénesis aberrante del colon en un modelo murino de cáncer colorrectal. Potenciales aplicaciones para un diagnóstico precoz y nuevas terapias. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Adur, Javier Fernando
Descripción
El incremento de la formación de criptas colónicas es un proceso clave que impulsa el crecimiento de los adenomas colorrectales. En la morfogénesis normal, son estructuras compactas cuyo eje luminal se orienta perpendicularmente a la superficie de la mucosa. Algunas mutaciones provocan la producción de criptas anormales y pérdida de su orientación, llevando a la generación de adenomas colorrectales. Actualmente, no se conoce con exactitud cómo ocurre la producción desordenada de las criptas. Tampoco existe una comprensión cuantitativa de los cambios espaciales que gobiernan la dinámica de la señalización bioquímica que lleva a una cripta nueva a transformarse en adenoma. Para responder a estas incertidumbres, en el presente proyecto se trabajará sobre el cáncer colorrectal (CCR), químicamente inducido en un modelo murino. Se realizará un análisis sistemático en el que se procesarán los datos obtenidos y se modelará la criptogénesis aberrante del colon; utilizando para ello un enfoque de la teoría de la biología de sistemas. Este abordaje implicará primero, la identificación y tipificación de los cambios morfológicos tempranos, que preceden al desarrollo del cáncer.

Generación de una línea transgénica de pez cebra para estudiar la remodelación de uniones adherentes. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dra. Sigot, Valeria
Descripción
El proyecto consistirá en un desarrollo científico-tecnológico para la generación de una nueva línea transgénica estable y fluorescente de pez cebra que permitirá investigar la distribución de cadherinas y el remodelado de UAs (uniones adherentes) durante procesos dinámicos como la migración celular.

Digitalización de imágenes del Microscopio Electrónico de Barrido HITACHI HHS-2R. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Bioing. Laugero, Silvio
Descripción
La presente propuesta pretende realizar una actualización tecnológica del sistema de visualización y registro de las imágenes del HHS-2R, adaptándolo a las nuevas tecnologías y posicionándolo como un equipo más versátil y con mejores prestaciones para los estudios de investigación y servicios a terceros, tanto de la FIUNER como de la Región. El proyecto involucra el desarrollo de un sistema de registro de imágenes a través de componentes electrónicos y de una computadora, así como el desarrollo de un software asociado que administre la adquisición, análisis y manipulación de las imágenes adquiridas. Específicamente, se implementará un sistema de adquisición de la señas de video del MEB, basado en una PC y su posterior reconstrucción y procesamiento, para ser observada en un monitor moderno y almacenada mediante medios digitales, que posibiliten su administración posterior.

Secuenciación y caracterización de los transcriptos de b-catenina de Rhinella arenarum ecuenciación y caracterización. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dra. Galetto, Carolina
Descripción
β-catenina es una proteína citosólica muy conservada entre especies de metazoos y no metazoos, que interviene en numerosos procesos biológicos esenciales durante el desarrollo y el mantenimiento normal de los tejidos. Actúa como plataforma para múltiples interacciones con numerosas proteínas, dando lugar a sus dos funciones principales, la adhesión celular y la activación transcripcional de diversos genes involucrados en el control de la morfología y del ciclo celular. Dada su importancia en los procesos celuares en los que interviene, es el centro de innumerables estudios estructurales, funcionales y evolutivos. Así, nuestro grupo de trabajo se ha centrado en el estudio de los mecanismos moleculares que controlan la dinámica de las uniones adherentes, mediadas por el complejo cadherina E/β-catenina utilizando como modelo experimental al sapo Rhinella arenarum. Para avanzar en este objetivo es esencial conocer la secuencia nucleotídica completa del ARN mensajero (ARNm) de β-catenina de esta especie. Nuestros estudios preliminares, recientemente publicados (Galetto y col., 2012), posibilitaron obtener un fragmento de 539pb del ARNm de β-catenina de Rhinella arenarum. Dado que para tener una base experimental más sólida, se necesita obtener la secuencia completa de dicho gen, el presente proyecto permitirá implementar la herramienta molecular requerida para tal fin. Para ello, el ARNm de β-catenina de Rhinella arenarum será aislado implementando la técnica de Amplificación Rápida de los Extremos de ADN copia (cDNA) (RACE-PCR), partiendo del conocimiento de una secuencia interna del ARNm de interés. Posteriormente, el ARNm obtenido será secuenciado y sus secuencias nucleotídicas y aminoacídica analizadas mediante diversas herramientas bioinformáticas, que permitan establecer una filogenia y la diferencias evolutivas con otras especies de metazoos y no metazoos.

Rol de la adhesión celular en la morfogénesis y el mantenimiento de la arquitectura epitelial. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Casco, Victor
Descripción
La morfogénesis y la arquitectura de un epitelio en desarrollo son controladas tanto por la forma como por los contactos celulares, mediados por moleculas de adhesión celular reguladas espacial y temporalmente. Desde hace varios años, nuestro grupo estudia el rol de la molécula de adhesión intercelular epitelial cadherina E, como factor clave de adhesión epitelial y en el establecimiento y mantenimiento de la arquitectura epiletial in vivo. Para avanzar en nuestros estudios, debemos correlacionar los estudios morfométricos con estudios moleculares por RT-PCR para detección y cuantificación de los ARNm de cadherina E y b-catenina y la secuenciación de los genes en Rhinella arenarum. Necesitamos analizar los patrones de expresión a nivel ultraestructural, aplicando microscopia electrónica de transmisión clásica, así como inmunohistoquímica de alta resolución. Finalmente, planificamos realizar un estudio morfométrico dinámico en montaje completo, utilizando microscopia de desconvolución digital de time-lapse. Para ello, desarrollaremos un microscopio de desconvolución digital a partir de la motorización de un equipo comercial y el desarrollo posterior de un software de desconvolución.

Desarrollo de una metodología de calibración para microscopia de fluorescencia multidimensional cuantitativa. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Diaz Zamboni, Javier
Descripción
La biología molecular y celular busca comprender las complejas funciones celulares y las interacciones célula-medio ambiente. Entre otras técnicas, las imágenes multidimensionales de microscopia contribuyen con información muy relevante, dado que las células y los tejidos son estructuras tridimensionales, que constantemente sufren cambios estructurales y funcionales en el transcurso de su vida, por lo que todas sus actividades ocurren en coordenadas espacio-temporales. La microscopia de fluorescencia es la base de la microscopia multidimensional. Básicamente, es un modo de microscopia óptica que utiliza el fenómeno de fluorescencia para la observación de especímenes. Es ampliamente aplicado en Biología Celular y Molecular, ya que permite la observación de sustancias fluorescentes que pueden ser específicamente localizadas usando diversas técnicas de marcación de estructuras celulares. Sin embargo, para realizar mediciones precisas es necesario corregir las imágenes de las degradaciones naturales que introduce el microscopio. En el presente proyecto se desarrollará una metodología de calibración para un sistema de microscopia multidimensional. Esta se basará en la correción de aberraciones que generalmente no son tenidas en cuenta en la microscopia óptica convencional. Se espera como resultado final el desarrollo de una técnica que asociada a un sistema de adquisición controlado por software permita realizar análisis cuantitativo sobre las imágenes digitales capturadas.

Estudios moleculares y celulares del sistema de endotelinas en cáncer colo-rectal. Proyectos de investigación científica, desarrollo e innovación tecnológica (PID-UNER)

Dir.: Dr. Casco, Victor
Descripción
En el presente proyecto se utilizarán técnicas de microscopia óptica y electrónica clásicas y de alta resolución (Microscopia de Desconvolución Digital) combinadas con técnicas de biología molecular y celular (RT-PCR, inmunohistoquímica, hibridación in situ, etc.), con la finalidad de establecer los roles del sistema de las endotelinas en el desarrollo de cáncer colo-rectal de mamíferos, usando ratones como modelo animal. Los estudios se llevarán a cabo sobre animales normales, animales inducidos a desarrollar cáncer colo-rectal con azoximetano y animales inducidos con azoximetano, sometidos al bloqueo de los receptores ETA y ETB en estadios previos al desarrollo de cáncer colo-rectal murino.